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Modele velum k line

Nous présentons ici une analyse du génome du S. velum symbiont. Premièrement, les gènes qui encodent les fonctions métaboliques de base sont discutés. L`accent est mis sur la bioénergétique, l`autotrophie, l`hétérotrophie et le métabolisme de l`azote, qui indiquent un potentiel métabolique au-delà de la chimiolithoautotrophie stricte. Les gènes codant les fonctions cellulaires qui se rapportent au mode de vie symbiotique sont également analysés. Un accent particulier est mis sur les processus, tels que le transport membranaire, la détection et la motilité qui peuvent être impliqués dans les interactions du symbiote avec l`hôte et l`environnement. Chaque fois que cela est approprié, la teneur en gène est comparée à celle des bactéries vivant en liberté et associées à l`hôte, en particulier les symbiontes chimiosynthétiques intracellulaires des palourdes vesicomyidés, Calypso Togena Magnifica [22] et Calypso Togena okutanii [20], le vestimentiféran tubeworms, Riftia pachyptila [31] et tevnia jerichona [32], l`escargot Scaly-pied, crysomollon squamiferum, [33] et le ver oligochètes marin, olavius algarvensis, [34]. Cette analyse complète définit le S. velum symbiote comme une bactérie métaboliquement polyvalente adaptée à la vie à l`intérieur de l`hôte, mais aussi potentiellement capable de survivre à l`extérieur.

Il informe les tentatives de culture des symbiontes et génère de multiples hypothèses intrigantes qui attendent maintenant une validation expérimentale. Deux scénarios d`évolution de la vie et de l`histoire évolutive peuvent expliquer la teneur observée des éléments mobiles dans le S. velum symbiont. L`un d`eux est un passage relativement récent à l`intracellularité, entraînant une expansion des éléments mobiles [107, 108]. Alternativement, les symbiontes peuvent subir des transmissions horizontales régulières ou occasionnelles entre les hôtes et, à ce moment-là, rencontrer des possibilités de recombinaison entre les souches. Par exemple, des épisodes sporadiques de transmission horizontale dans le symbionte d`insectes transmis principalement par la maternité, Wolbachié, ont abouti à l`acquisition et à l`entretien de nouveaux éléments mobiles [109, 110]. En fait, la transmission horizontale ou la commutation hôte a probablement eu lieu dans l`histoire des symbiontes de bivalves [111], y compris les membres du genre Solemya, car les analyses phylogénétiques de l`ARNr 16S montrent que ces symbiontes ne comprennent pas un clade monophylétique [5, 11]. En outre, un grand nombre des gènes du génome de S. velum symbiote sont plus étroitement liés à des taxons bactériens disparates (figure 3), ce qui suggère que le transfert de gènes horizontal peut avoir eu lieu dans le passé. Ces lignes préliminaires de preuve étayaient l`hypothèse selon laquelle la transmission du symbionte horizontal s`est produite.

Cependant, on a besoin de plus d`informations sur la distribution et les relations des éléments mobiles entre les populations intra-hôte et inter-hôte de S. velum symbiote avant que ces hypothèses puissent être différenciées. Le S. velum symbiote semble capable de synthétiser et d`assembler une membrane cytoplasmique, une couche peptidoglycane (PG) et une membrane externe peuplée de lipopolysaccharides (LPS), qui constituent une enveloppe cellulaire. Bien que ces capacités soient typiques des ?-protéobacteria vivant librement, deux aspects en particulier se distinguent dans le contexte du style de vie symbiotique. Premièrement, étant donné les gènes identifiés pour la biosynthèse des acides gras, le symbiote peut construire des composants de sa membrane plasmique principalement à partir de l`acide cis-VACCENIQUE (18: l?7) (figure 1). Selon une analyse antérieure de la composition lipidique chez S. velum [95], cet acide gras insaturé et ses dérivés sont les principaux constituants des membranes cellulaires dans le symbionte et l`hôte.

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